造成機箱屏蔽失效的另一個主要原因是穿過機箱的電纜。在實際中，很多結構上很嚴密的屏蔽機箱(機柜)就是由于有電纜直接穿過屏蔽箱而導致電磁兼容試驗失敗，這是缺乏電磁兼容經驗的設計師感到困惑的典型問題之一。
判斷這種問題的方法是將設備上在試驗中沒有連接的電纜拔下，如果電磁兼容問題消失，說明電纜是導致問題的因素。
解決這個問題有兩個方法：
1)對于傳輸頻率較低的信號的電纜，在電纜的端口處使用低通濾波器，濾除電纜上不的高頻頻率成分，減小電纜產生的電磁輻射(因為高頻電流 容易輻射)。這同樣也能防止電纜上感應到的環境噪聲傳進設備內的電路。
2)對于傳輸頻率較高的信號的電纜，低通濾波器可能會導致信號失真，這時只能采用屏蔽的方法。但要注意屏蔽電纜的屏蔽層要360°搭接，這往往是很難的。
在電纜端口安裝低通濾波器有兩個方法：
(1)安裝在線路板上，這種方法的優點是經濟，缺點是高頻濾波效果欠佳。顯然，這個缺點對于這種用途的濾波器是致命的，因為，我們使用濾波器的目的就是濾除容易導致輻射的高頻信號，或者空間的高頻電磁波在電纜上感應的電流。
(2)安裝在面板上，這種濾波器直接安裝在屏蔽機箱的金屬面板上，如饋通濾波器、濾波陣列板、濾波連接器等。由于直接安裝在金屬面板上，濾波器的輸入、輸出之間隔離，接地良好，導線上的干擾在機箱端口上被濾除，因此濾波效果理想。缺點是安裝需要的結構配合，這在設計初期進行考慮。
由于現代電子設備的工作頻率越來越高，對付的電磁干擾頻率也越來越高，因此在面板上安裝干擾濾波器成為一種趨勢。一種使用方便、性能優越的器件就是濾波連接器。濾波連接器的外形與普通連接器的外形相同，可以直接替換。它的每根插針或孔上有一個低通濾波器。低通濾波器可以是簡單的單電容電路，也可以是較復雜的電路。
解決電纜上干擾的一個簡單的方法是在電纜上套一個鐵氧體磁環，這個方法雖然往往，但是有一些條件。許多人對鐵氧體寄予了過高期望，只要一遇到電纜輻射的問題，就在電纜上套鐵氧體，往往會失望。鐵氧體磁環的效果預測公式為：共模輻射=20lg(加磁環后的共模環路阻抗/加磁環前的共模環路阻抗)例如，如果沒加鐵氧體時的共模環路阻抗為100Ψ，加了鐵氧體以后為1000Ψ，則共模輻射為20dB。
這說明有時套上鐵氧體后，電磁輻射并沒有明顯的，這并不是鐵氧體沒有起作用，而可能是除了這根電纜以外，還有其他輻射源。
在電纜上使用鐵氧體磁環時，應注意到下列一些問題：
①磁環的內徑盡量小；
②磁環的壁盡量厚；
③磁環盡量長；
④磁環盡量靠近電纜的輸入端頭處安裝。
